Jean-Luc Hees est nommé directeur de France Inter en 1999 par Jean-Marie Cavada, président-directeur général de Radio France. En 2004, à l’arrivée de Jean-Paul Cluzel à la tête de Radio France, il est remplacé par Gilles Schneider.
Il est engagé par Radio Classique en 2006 où il anime les émissions Hees bien raisonnable et, à partir de 2007, Hees comme société, avant d'être en charge de la tranche matinale de 8h à 10h à la rentrée 2008. Il tient par ailleurs une chronique dans Charlie Hebdo, particulièrement durant la campagne présidentielle américaine de 2008.
Nommé président de Radio France en mai 2009 par Nicolas Sarkozy, Jean-Luc Hees succède à Jean-Paul Cluzel à compter du 12 mai 2009. Il quitte ses fonctions le 11 mai 2014.
Extrait du répertoire numérique détaillé du versement aux Archives nationales n°20150053 établi par le Service Archives écrites et Musée de Radio France en 2015
Les archives de Jean-Luc Hees aux Archives nationales
Les archives de l'émission Synergie de Jean-Luc Hees sont inventoriées et ont fait l’objet d’un versement aux Archives nationales où elles sont désormais consultables.
Versement n° 20150053. Emission Synergie de Jean-Luc Hees diffusée sur France Inter : archives papier (1990-1999)