Matthieu Amiot débute sa carrière chez Arthur Andersen en 1996 comme Auditeur Financier. Il rejoint ensuite le Groupe Yves Rocher où il exerce pendant 8 ans, d'abord comme Contrôleur de Gestion sur les coûts de structure de la marque Yves Rocher, puis comme Contrôleur Financier de Françoise Saget (linge de maison).
En 2006, Matthieu Amiot rejoint le groupe Psychologies Magazine en tant que Responsable Financier.
En 2009, Matthieu Amiot rejoint le groupe Lagardère Active, tout d'abord comme Directeur Financier des régies publicitaires (Radio, TV, Presse et Digital) au niveau régional, national et international. Son périmètre inclut également les antennes de Virgin Radio et RFM en région.
Dans un contexte d’évolution des activités du groupe et de transformation de son modèle économique et financier historique, ses missions s'élargissent ensuite aux marques de Presse ainsi qu'aux projets numériques transverses.
Matthieu Amiot a pris ses fonctions à Radio France le 17 février 2020.